环状RNA成环验证实验哪里能做?
功能验证可以通过荧光定量PCR实验来实现,先设计特异性引物,然后取样检测。
庄树谆说,这个研究除设计大数据分析流程来建构环状RNA的调控网路关系,也结合分生实验验证,团队挑选一个在自闭症患者脑部表现量明显上升的环状RNA(命名为circARID1A),于人类神经细胞实验验证后发现,circARID1A确实可借由调控微RNA(miR-204-3p),影响下游多个自闭症风险基因的表达。
通过在搜索界面中的list search提交circBase支持的circRNA ID号或基因组区域位置信息,可以快速查询相关circRNA信息;研究者也可以通过tablebrowser进行条件设置,筛选自己所需要的circRNA数据。
circRNA Northern blot验证 Northern blot方法是一种比较古老但行之有效的序列验证方法,需围绕circRNA设计探针序列,而探针序列设计是验证成功至关重要的环节。
环形RNA分子最近数年才引起研究人员注意,而此前的研究主要集中于线形RNA分子。单革教授实验室发现的新型环状非编码RNA,被命名为外显子-内含子环形RNA。在论文中,他们还对这类新型环状非编码RNA为何会成为环形而不是线形分子进行了研究,发现成环序列两端经常会有互补的重复序列存在。
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